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manta是哪里呀?manta的寓意

370SEO1年前 (2024-02-14)189

manta是哪里呀?

manta是马纳比省。曼塔是厄瓜多尔的城镇,属于马纳比省。在太平洋曼塔湾南岸查拉波托河畔,东南距瓜亚基尔160公里。

厄第二大港口城市,是厄海产品加工和出口中心。厄海主要海、空军基地之一。

manta的寓意

manta

 英 [ˈmæntə]            美 [ ˈmæ扮腔ntə]    

n.    毯行谈魟,双吻前口蝠鲼 (体宽大于长,见于暖水海域);    

[例句]The lab is also building a robot manta ray to study fish stocks in the fjords of British Columbia.

这间研究技工同时还在制造一种机器蝠鲼,以便对不列颠哥伦比亚的峡湾进行研究探档缺碰测。

[其他]   

 复数:mantas    

(附图说明)


下面分享相关内容的知识扩展:

连淮伟Manta初舞台,重新回到舞台的训练生连淮伟为何现在才选择公布?

因为连淮伟是节目的热门选手之一,保持悬念有助于吸引流量。

因为早在《青春有你》的时候连淮伟就有很多的关注和粉丝,所以他这一次参加《青春有你3》引来了很大的热议,毕竟很多和他同一届出来的选手现在都发展得很不错,而作为当时热门的成团人选的他却再一次回到了这个舞台。是弥补之前的遗憾还是再一次和出道擦肩而过是很多人都关注的事情。

一、曾经和出道位一名之差,成为意难平

在《青春有你》之一季的时候其实连淮伟的实力就已经得到了很多人的认可,并且在很多次的排名公布中都取得了第六名左右的好成绩。甚至得到了像孙坚这些艺人的支持,但是最终在决赛之夜的时候他以第十名的成绩错过了九人团的出道机会。有不少的网友都觉得这是这届青你更大的意难平,相关的话题也长时间地挂在微博热搜。

一文读懂SV检测软件Manta的结果文件

Manta运行完毕后,将在 $ {MANTA_ANA *** SIS_PATH}/results/variants 目录下输出一组VCF格式的结果文件。

无论是 diploidSV.vcf.gz , somaticSV.vcf.gz 还是 tumorSV.vcf.gz ,他们描述sv的规则是一致的,只是在记录的信息上略有不同。如,

使用 gzip -d -c *.file.gz > *.file 命令可生成解压缩的VCF文件。

对于大的片段缺失,在VCF中 ALT 一列会有 <DEL> 的标志, ID 中将以 MantaDEL 开头,使用 grep "<DEL>" diploidSV.vcf 命令可以直接将这一类的变异提取出来。 CHROM 和 POS 中记录的是该Deletion在参考基因组上的起始位置, FORMAT 中 END 记录的是Deletion在参考基因组上的终止位置, SVLEN 记录的是缺失片段的长度。
FORMAT 中的 PR 和 SR 记录的是支持REF和ALT基因型的Paired Reads数和Split Reads数。
在 diploidSV.vcf 中还会在 FORMAT 中包含基因型相关的信息,如GT,GQ, PL等(不懂这些概念?请参考: https://software.broadinstitute.org/gatk/documentation/article.php?id=1268 )。

对于大的片段插入,Manta会在 CHROM 和 POS 中记录DNA片段的插入位置,并在 ALT 中加入 <INS> 的标志, ID 中将以 MantaINS 开头。这里插入的“DNA片段”,个人理解指的是外源的DNA片段,即无法比对到参考基因组,或者无法比对到参考基因组唯一位置。因此,Manta只能通过断点附近的reads得到插入片段两端的序列,但无法将整个插入片段的序列组装起来(如果有不同意见,欢迎留言讨论)。 INFO 中的 LEFT_SVINSSEQ 和 RIGHT_SVINSSEQ 给出了插入片段左右两端的序列信息。

Manta中,符合以下几个条件的插入或缺失会被归类于 *** all indels:

虽然这些小的indels的ID也以 MantaDEL 或 MantaINS 开头,但在VCF中的表示方式和前述的DEL和INS不同,Manta将这些变异的完整的插入/缺失序列给在了 REF 或 ALT 中。并且会在INFO中增加 CIGAR 标签,对此类变异进行描述。

Manta没有办法检测散在重复(Dispersed duplications),但可以检出串联重复(Tandem Duplicate)。

Manta对于染色体间易位和染色体内易位不做特殊区分, ID 都以 MantaBND 开头,BND即breakend的缩写。在 CHROM 、 POS 中展示之一个断点位置,在 ALT 中展示第二个断点位置,例如: A]10:115172011] 、 [12:70547434[C 。通过比较之一个断点和第二个断点的染色体,可以判断是染色体间易位还是染色体内易位(这里为了描述方便,使用了“之一个断点”、“第二个断点”的描述方式,事实上两个断点并没有顺序之分)。
值得注意的是, ALT 中方括号的方向在判断融合基因中有重要的作用。 ...]...] 指易位序列在之一个断点位置的3'端, [...[... 指易位序列在之一个断点位置的5‘端,如下图。

染色体片段在易位的过程中,可能会平移并连接到另一段染色体上(见下图 variant a),也可能翻转之后再连接到另一段染色体上(见下图 variant b)。具体看上面的两个例子,其中 example1 的两条记录ALT中的方括号方向不一样,它对应的是variant a这种情况; example2 的两条记录中方括号方向一致,对应的是variant b这种情况。

在默认情况下,Manta会用4条BND记录来表述一个倒位事件,并且这四条记录拥有相同的 EVENT 标签。下面是官网上给的例子:

但开发者另外提供了一个脚本 $MANTA_INSTALL_FOLDER/libexec/convertInversion.py 可以将BND记录的Inversion转换成另一种形式(见下),并以 MantaINV 作为 ID 的开头,每条记录表述一个新的连接点的信息,位置信息记录在 CHROM 和 POS 中。一条标准的Inversion应该有两连接点的记录,并且拥有相同的 EVENT 标签。

另外,在Inversion的记录中, INFO 中还提供了 INV3 、 INV5 两个标签,INV3指发生倒位的序列位于此记录报道的连接点的3'端,INV5指发生倒位的序列位于此记录报道的连接点的5'端。在IGV中,INV5标签对应的是"RR" reads,INV3标签对应的是"LL"reads(可参考我的 另一篇笔记 )。
需要注意的是,在实际应用中得到的VCF完成格式转换后,存在很多虽然标注为 Manta:INV ,但只有一条记录情况,因此实际上并不是一个标准的Inversion事件。

不同的SV检测软件都有自己的一套描述规则,有很多细节值得琢磨,以后有新的体会再慢慢补充。

乘风破浪之一季更好听的十首歌woman?

1.《无价之姐》

这首歌是综艺节目《乘风破浪的姐姐》的主题曲,由李宇春作词兼演唱的歌曲。这首乘风破浪音乐歌曲以女性视角展开,戏谑而潇洒的歌词在轻快摇摆的复古旋律中释出,“无价之姐”绽放自己时的热烈欲望和无所顾忌的快乐蕴含其中。该曲推出后受到广泛关注,引发无数翻唱、翻跳,成为现象级歌曲,还获得了2020年BME音乐盛典年度优秀歌曲奖和第二届腾讯音乐娱乐盛典年度十大金曲奖。

2.《大碗宽面》

之一次公演的七人组的《大碗宽面》真的很惊艳,又燃又美,绝对可以原地出道了。这首歌被姐姐们改编后,真的很好听,李斯丹妮、孟佳的Rap铿锵有力,郁可唯、张含韵的戏腔惊艳夺目,沈梦辰、金晨声音很有辨识度,王菲菲美艳帅气,七人合唱融合完美。

3.《情人》

是乘风破浪姐姐们更好听的歌之一。李斯丹妮组的《情人》非常性感,每个姐姐都换成了紫红色裙子,虽然衣服可能是艳俗,但姐姐的魅力完全掩盖了它的不足,而且姐姐们为了这个舞台学习的钢管舞,在舞台难度上上升了一个台阶,这是非常加分的,再加上最后的ending pose太美了,配得上之一。

4.《逆战》

宁静组最后一轮的公演的表演曲目,由王霏霏、孟佳、宁静、蓝盈莹和郑希怡这五个姐姐表演,她们的这场舞台瞬间燃爆了全场,诠释了姐姐的姿态,诠释了姐姐的态度,不管年龄如何,一定要乘风破浪,勇往直前,和人生战斗。

5.《Manta》

由王霏霏、万茜、沈梦辰表演,获得了第四名的成绩。《Manta》这首歌是刘柏辛的原创歌曲,曲调暗黑婉转,听了忍不住想让人循环播放。此次姐姐们表演的这首歌,给人们的感觉完全不一样,非常符合现在年轻人的口味,姐姐们的表演也是又美又飒,惊艳全场。

6.《傲娇》

这首歌是天后张惠妹的一首热歌,被歌迷戏称为“呛辣神曲”,整首歌主题偏唱跳,十分符合这组姐姐们的风格。郁可唯组在歌曲《傲娇》中表演的椅子舞性感魅惑,引发全场尖叫。

7.《这是因为我们能感到疼痛》

该曲Tizzy Bac演唱的歌曲,在《浪姐》第二次公演中,由孟佳组表演,获得第三名的成绩。这一组的舞台表现是十分惊艳的,从开场就很独特,孟佳、张含韵、金晨三人头对着头,躺在地上,蜷缩成一团,看着就很令人触动,这种姿势其实是一种对自我的保护姿势,随后姐姐们的歌声、表情搭配触动人心的歌词,很打动现场观众,而且三人的舞蹈都带入了感情进去,彼此的互动表现出了歌曲蕴含的深意。

8.《用尽我的一切奔向你》

第二次公演中,由蓝盈莹组表演,获得第五名。虽然这首歌排名不是很靠前,但她们三人配合默契,在舞台上表现出既柔美又飒爽的气质,而且改编的歌词也让人记忆尤深。

9.《人美路子野》

第三次公演中,由宁静组表演。当宁静、郁可唯、王丽坤、白冰、王霏霏五位姐姐扮上酒醉的公子、妩媚的女子等形象,融入了中华武术、醉酒等舞蹈动作,展示了不同风格的美和野,也让不少观众直呼次元壁被打破。该曲可以说是乘风破浪的姐姐更好听的十首歌之一。

10.《Last Dance》

在《浪姐》总决赛的舞台上,宁静组全体成员7个人一起带来了唱跳版的《last dance》,姐姐们将rap、民族、迪斯科等多种风格,呈现出了这首歌一种新的可能。

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